甲状舌管囊肿的手术，通常需要20-30分钟。甲状舌管囊肿手术，实际较为简单，是肿物的切除术，所以手术时间较短，有经验的医生可能20分钟即可结束手术。由于手术没有较大难度，周围也不存在重要器官，需要进行功能保护。甲状舌管囊肿手术，需要注意将囊肿的附着点切除干净，要求最好在舌骨的附着点，通过咬骨钳切除部分舌骨，保证囊肿可以完整切除。通常术后复发率较低，能够达到较为满意的治疗效果。
甲状舌管囊肿病属于先天畸形，如果囊肿较小，没有感染迹象以及发展表现，病人没有任何症状，可以无需进行手术，观察也是较好的选择。所以甲状舌管囊肿的患者，术前需要评估手术的必要性。并且手术相对较为简单的手术，如果头颈外科的医生，对局部结构较为了解，手术通常在20-30分钟完成。
