肾囊肿主要是良性的居多，可单发，亦可多发，通常不严重。绝大多数肾囊肿都是单纯性肾囊肿，几乎没有恶性的可能，肾囊肿的治疗主要以观察为主。对于过大的囊肿可以进行微创治疗，如果较复杂，可以进行手术治疗。
肾囊肿是一种发病率非常高的疾病，绝大多数的肾囊肿随着年龄的增长而出现发病率增高的现象。
1、当囊肿过大，比如直径大于8cm，或囊肿严重压迫肾实质，影响肾功能，以及囊肿反复感染，影响生活，可采取微创手术的方法将囊肿处理。
2、少部分囊肿表现比较复杂，可以出现明显的分隔或囊肿内出血，以及囊壁两侧有实质性成分，这类囊肿有一部分可以为恶性的肿瘤，应当根据增强CT或磁共振的结果来判定。当怀疑囊肿有恶性的可能时应当及时进行手术。若病灶不大，病情许可，建议将此类囊肿完整切除，保留肾实质，并根据病理的结果决定后续治疗方案，做好定期复查，避免恶性肿瘤复发及转移。
