感染性结石是由于致病菌感染尿路后，分泌尿素酶分解尿液中的尿素，经过一系列化学反应后，形成结石。感染性结石的主要成分是磷酸镁铵和碳酸磷灰石。能够分泌尿素酶的致病菌很多，包括变形杆菌、肺炎杆菌、绿脓杆菌、大肠杆菌及尿素支原体等，最常见的是奇异变形杆菌。
致病菌感染尿路后，分泌尿素酶，尿素酶将尿素分解为氨和二氧化碳。氨和水结合形成铵盐，铵盐与尿液中的镁和磷酸根结合形成磷酸镁铵。二氧化碳与水结合形成碳酸氢盐，使得尿液呈碱性。尿液中钙离子、磷酸根及二氧化碳在碱性环境中结合形成碳酸磷灰石。
感染性结石生长较快，常充满肾脏管道，形成铸型结石。结石堵塞管道，加上感染，容易损害肾功能，因此需要积极治疗，通常需要手术清除结石。术后残留结石和感染导致结石很快复发再次形成铸型结石。因此，术中应尽可能清除结石，术后需要积极控制尿路感染及酸化尿液，防止结石复发及过快生长。
