牙周炎本身作为感染性的疾病，无论是服用阿莫西林还是头孢，都有一定抗感染作用，但是牙周炎一定要说明，无论哪种药物针对牙周炎治疗效果都是不理想的，牙周炎最好的治疗办法，就是到专业的口腔科进行牙周治疗，因为引起牙周炎主要的原因并不仅仅是细菌，还因为龈下的牙石，龈下的牙石大部分情况下，是由细菌、菌斑一层一层沉积而来，牙石不去除，通过应用药物的方法不可能治疗牙周炎。

治疗牙周炎需要龈上洁治、龈下刮治，联合根面平整等一系列牙周治疗的办法，使牙周的菌斑和牙结石得到较好、较充分的清理，才能使牙周较为卫生。这时可以考虑外用药物，例如盐酸米诺环素软膏，同时如果要口服药物，针对于牙周炎，甲硝唑是相对更加对症的药物。