治疗牙根囊肿，首先需要对囊肿的患牙进行根管治疗，其次在局麻下对囊肿组织进行彻底刮除，最后需要对囊肿的牙根组织进行根尖切除，才能够彻底治疗牙根囊肿防止复发。

根管治疗大概是400元每个根管，根尖周囊肿的刮除术大概是500元，局部麻醉费大概是50元，根尖切除术大概是330元每颗。综合下来根尖周囊肿手术，治疗费用大概在1000元左右，囊肿范围过大费用会更高。