胰腺囊肿分为胰腺真性囊肿、胰腺假性囊肿，具体病因如下：

一、胰腺真性囊肿

1、胰腺导管系统的先天性畸形：较少见，胰腺导管系统先天畸形可表现为主、副胰管完全未融合或以细的分支胰管的吻合为特征，导致胰液引流不畅而易导致胰腺炎。

2、胰管阻塞：是后天获得性胰腺真性囊肿，多由于胰管阻塞导致远侧胰管或腺泡发生囊性扩张。

二、胰腺假性囊肿

1、外伤性囊肿：多发生于胰腺外伤或手术后。

2、炎症性囊肿：一般发生于急性或慢性胰腺炎后。

炎症或外伤时，胰管破裂，胰液外漏，引发周围炎性反应，产生一层纤维素性渗出物包裹外漏胰液。经过数周后，纤维素壳变成强韧的纤维包膜，形成囊肿。这种囊肿不像其他囊肿一样，具有内皮细胞外膜，故称为假性囊肿。