气功所致精神障碍具体病因并不完全清楚，可能与以下原因有关：

1、遗传因素：有精神疾病家族史者，其患病率高于一般人群。

2、意识改变状态：气功锻炼过程本身就是在心理暗示下进入自我诱发的意识改变状态，称之为“气功态”，此时可出现各种心理变化。若气功态下感知的内容对自己有利，引起正性心理效应，导致情绪愉快、精力充沛、自我评价高、自信等。若气功态下感知的内容对自己不利，引起负性心理效应，导致相应的思维、情感、行为改变，认为是气功偏差或”走火入魔”，导致出现相应的精神障碍，意识改变状态是气功所致精神障碍的发病基础。

3、人格因素∶练习气功者在气功训练开始渴望得到身心的高水平境界和治疗效果，存在急于求成和刻意追求的心理冲突，此时具有表演性人格、焦虑性人格、分裂样人格等人格特征者，心理冲突反应强烈容易发生相应的精神障碍。

4、其他因素：有研究认为气功所致精神障碍是由于练功者个人操作不当，没有掌握练功要领，违反松静、自然原则，缺乏自控能力造成的；也可能与练功时间过长，身心无法得到充分的休息与调整，产生不良情绪所致。