毛细血管的基本功能是作为血液与组织细胞间进行物质交换的通透性屏障，决定其通透性的主要结构是内皮细胞，基膜也有一定作用，根据电镜下内皮细胞的结构特征，毛细血管可分为以下三类：

1、连续毛细血管：内皮细胞间有紧密连接封闭了细胞间隙，基膜完整，胞质中含大量质膜小泡，质膜小泡是血液和组织间进行物质交换的主要方式。主要分布于结缔组织、肌组织、外分泌腺、神经系统、胸腺和肺等，参与了屏障性结构的形成。

2、有孔毛细血管：内皮细胞间也有紧密连接，基膜也完整，但在内皮细胞不含核的部分极薄，有许多贯穿胞质的内皮窗孔，窗孔直径60-80nm，一般由厚4-6nm的隔膜封闭。内皮窗孔有利于血管内外的中、小分子物质交换。主要分布于胃肠黏膜、某些内分泌腺和肾血管球等。

3、血窦：也称窦状毛细血管或不连续毛细血管，管腔较大，直径可达40nm，形状不规则。内皮细胞间的间隙较大，有利于大分子物质甚至血细胞出入血管。主要分布于肝、脾、骨髓和某些内分泌腺，不同器官内的血窦差别较大。