导致消化性溃疡最主要原因是胃酸分泌过多，胃酸、胃蛋白酶的侵袭作用与黏膜的防御能力之间失去平衡，导致黏膜自我消化形成溃疡。抑制胃酸，减少侵袭作用是治疗消化性溃疡最主要的原理，虽然胃蛋白酶也是发病机制中的重要因素，但是需要在酸性条件下才具有酶的活性，因此抑制胃酸可以同时抑制胃蛋白酶的活性。幽门螺旋杆菌也是导致消化性溃疡最主要的原因，幽门螺旋杆菌依靠鞭毛穿过黏液层，定植于黏液层与胃窦黏膜上皮细胞的表面，凭借其产生的氨和空泡毒素导致上皮细胞损伤，促进上皮细胞释放炎症介质而引起自身免疫反应，损伤黏膜的屏障，所以容易导致消化性溃疡的发生。