运动后膝盖酸痛主要有以下几种原因：1、运动量过度，也是最常见的原因，运动没有遵循循序渐进的原则，运动量突然增加，对膝盖周围的肌肉产生轻度的损伤，从而引起疼痛。2、运动前没有做充分的热身运动，特别是在天气寒冷的情况下突然急性运动，对周围的肌肉也是一种损伤。3、运动的姿势不正确，如跑步时忽快忽慢，急转弯对膝盖有可能造成损伤而引起疼痛。4、膝盖本身存在病变，运动只是一个膝盖疼的诱因，运动后出现酸痛。这种情况应该咨询临床医生以后再进行运动，看采取何种方式运动，防止膝盖的二次损伤。