杞菊地黄丸和六味地黄丸可以一起吃，但是在临床具体应用时不建议这样使用。因为二者的配方基本相同，只不过杞菊地黄丸比六味地黄丸多了枸杞子和菊花两味中药，所以如果二者一起用，有可能会因为其药量过大，从而影响脾胃的运化功能，有可能会出现消化不良的症状。
所以在具体应用时，如果是单纯的肾阴虚，建议只服用六味地黄丸就可以。如果是肾阴虚到一定程度，虚火内扰的症状比较明显，比如像出现手脚发热、心烦、潮热盗汗、口干、失眠等症状，可以单独选用杞菊地黄丸就可以，没有必要二者一起服用。