目前桥本氏甲状腺炎尚无根治的方法，治疗主要目的是纠正继发的甲状腺功能异常、缩小显著肿大的甲状腺。轻度弥漫性甲状腺肿，又没有明显压迫症状，不伴有甲状腺功能异常的患者，无需特殊治疗，可以随诊观察。对于甲状腺肿大明显，并且伴有压迫症状的患者，可以采取左甲状腺素治疗，以减轻甲状腺肿胀。如果患者有甲减，则采用甲状腺激素替代治疗。一般对桥本氏甲状腺炎患者不宜采用手术治疗，不适当的切除，将促使甲状腺功能减退提前发生。若桥本氏甲状腺炎合并甲状腺癌或者恶性的淋巴瘤，需要进行根治性的手术。