肺部的肿瘤标记物应该查的项目有很多，其中包括蛋白质、内分泌物质、酶、肽类和各种抗原物质。
应用相关抗原如CEA、Cyfra21-1、NSE及可溶性膜抗原，某些酶如α1-抗胰蛋白酶（AAT）、胎盘碱性磷酸酶（PAKP）、淀粉酶、芳香烃羟化酶（AHH）、唾液酸、磷酸己糖异构酶（PHI）、乳酸脱氢酶的同工酶（LDH5、LDH3）以及谷胱甘肽S-转移酶等，作为观察病情变化的参考指标。