全身麻醉的副作用包括吸入麻醉和静脉麻醉的缺点，全身麻醉以后要用静脉药，这些静脉药可能会造成的影响是药物不良反应。比如有些人对某些药物可能比较过敏，如对吸入药物、静脉药物有过敏反应。用了药以后，要进行呼吸干预，比如气管插管，使用呼吸机。这时可能会有插管困难，有些患者会有气管痉挛。
手术中有可能引起血流动力学变化，因为所有麻醉药对心脏都有一定抑制作用，可能出现血压降低、心率减慢。这时可以相应进行调整用药，改善情况。如果术后有恶心、呕吐情况，可以用药物进行止吐、止痛。在整个麻醉过程中，全身麻醉所有的副作用都会提前有相应预案，一旦有副反应发生，医生会及时进行处理。
