肾透明细胞癌发病原因目前尚未明确，流行病学发现吸烟、肥胖、高血压、遗传等为相关因素，如吸烟较不吸烟患者发病风险高两倍，肥胖患者较不肥胖患者发病风险高。

肾透明细胞癌约有4%左右是遗传性肾癌，常染色体3号染色体VHL基因突变，导致VHL病是遗传性肾癌的重要发病因素。肾细胞癌常见病理类型为透明细胞癌，约占80%-90%，发病因素较多。