肌肉酸痛有时不仅表现在健身以后，只要是运动量过大以后，比如长跑、马拉松等都会出现肌肉酸痛。因为健身时肌肉要运动，肌肉运动要消耗肌肉内的氧，消耗氧以后肌肉代谢产生酸性物质，这种酸性的物质刺激神经末梢以后会出现酸痛的感觉。
另外，比如长跑运动员也是肌肉运动以后做功消耗氧产生ATP，同时也产生酸性代谢物质，这些物质都会引起肌肉组织、运动器官感觉出现酸痛。这些酸痛多数可以短期休息以后或者理疗、热敷后随着血液循环建立以后，把酸性物质带走，则会缓解肌肉酸痛的症状。