巨骨穴位于肩背部，锁骨肩峰端和肩胛骨上肩胛冈之间的凹陷处。巨骨穴是大肠经穴位，可以治疗各种肺系疾患及肠腑疾患。肺系疾患如各种咳嗽、气喘、胸闷、胸胀、咽喉肿痛、咽干、咽痒、喉中有痰，及各种肺炎、支气管炎都可以选取巨骨穴来进行治疗。

肠腑疾患如腹痛、腹泻、便秘、大便干、溏泄、消化不良、完谷不化，也可以选取巨骨穴。巨骨穴位于肩上两骨之间，下面是肺脏，因此针刺时以平刺或斜刺为主，不能过深直刺，以免伤及肺脏。在临床上，巨骨穴还可以治疗瘰疬、瘿瘤、肩关节的各种疼痛。