肾囊肿的手术目前是以微创手术(腹腔镜手术)为主，大多数患者，都没有特殊后遗症。腹腔镜手术创伤小、恢复快、并发问题少，是一个安全、有效的治疗手段。可能会有少数患者，会有伤口不适感，但是没有后遗症，并不代表其没有并发问题。肾囊肿手术，尽管是相对较小的手术，但术后也可能存在并发问题，具体如下：

1、出血：肾囊肿术后出血的主要原因，在于囊肿过于接近肾门部，由于肾静脉的小的静脉分支在术中损伤，会导致出血发生。一般通过腔镜下的处理，能达到止血目的；对于出血量较多的情况，必要时，还要行传统的开刀手术进行处理；

2、尿漏：尿漏发生的原因主要是有以下几点，一个是存在囊肿和集合系统相通，但术前检查未能够发现；另一个是囊肿和集合系统相邻，两者距离太近、间隔太薄，在术中电凝等处理造成损伤，引起尿漏；此外还有引流管放置位置不太合适，压迫局部、导致缺血坏死，从而导致尿漏。对于此类尿漏的处理，通常是保留较长时间的引流管，必要时放置双J管，让肾盂内处于低压状态；

3、损伤：此外还有损伤问题，若损伤在右侧，如肝脏、十二指肠等部位，若损伤在左侧，如胰腺、脾脏、结肠损伤。若存在器官损伤就会出现相应并发症。