目前全球范围内已经上市的疟疾疫苗，在注射后3个月的有效率仅达到50%左右，在疫苗注射后的18个月，即1.5年，其有效率会出现显著性下降，即低于30%。
由于疟原虫进入体内后，根据感染的不同阶段，以及寄生的不同器官，所表达的蛋白和抗原也不同，因此疟疾疫苗在全球范围内仍未达到成熟、有效、保护时间较长的效果。
由于疟疾疫苗的保护效率较低、保护时间较短，因此需采取综合性的预防措施，以避免感染疟疾。对于进入到疫区的人群，可采取物理性的防护措施，如喷涂避蚊胺，或穿长衣长裤，以避免蚊虫叮咬，或在蚊虫活动的非高峰时间出行，从而降低患疟疾的可能性。
还可以口服治疗疟疾的药物，以短暂性地进行疟疾的预防。
