穿刺活检需要通过穿刺针扎入到肿瘤生长的区域，从而活检到有代表肿瘤意义的活检组织。扎针的过程可能会有一点不舒适的感觉，但是大多数活检是在麻醉的情况下做的，比如会采取局部浸润麻醉的方式，对人体皮肤表面进行特殊麻醉，所以再扎针过皮肤时，就不会特别疼。
另外穿刺针穿刺由于已经在路径上进行沿途麻醉，所以穿刺针穿刺到人体不会有明显的剧痛。当然不同的肿瘤，所在位置不同。而且不同的脏器会有不同的神经解剖分布，这时需要有特殊的麻醉技巧。以肺癌为例，穿刺肺癌肿瘤，主要是在皮肤表面进行麻醉，也需要在人体神经比较密集的肺脏表面，即胸膜区域进行特殊麻醉，如果两个特别关键的解剖位置进行了良好的麻醉，再进行肺脏穿刺，人体就会感觉比较舒适。
