月经期间细菌性阴道炎可以口服甲硝唑来治疗。细菌性阴道炎是由于阴道局部菌群失调所导致，如果在某些情况的作用下，乳酸杆菌等优势菌减少，加德纳杆菌等杂菌增多，就会出现细菌性阴道病，也就是细菌性阴道炎，此时需要使用相应的治疗。
细菌性阴道炎患者可以口服或者阴道使用甲硝唑或者克林霉素的相关药剂，也可以同时使用能够促进乳酸杆菌恢复，含有乳酸杆菌的阴道胶囊。但是在月经期间，由于有经血流出，无法进行阴道上药，只能采用口服用药，此时就可以在医生指导下口服甲硝唑7-10天。
等到停药后3-7天，月经通常也已经结束，此时便可以进行复查。如果病原微生物转为阴性，线索细胞消失，则代表临床治愈，否则可能需要改用其他方法，比如阴道上药或者是口服其他药物来治疗。
