输尿管镜取石术疼痛明显，通常需要在麻醉状态下进行，疼痛来源如下：

1、男性输尿管结石，做输尿管镜的过程中，男性尿道比较长，有两个生理性弯曲，输尿管镜通过弯曲，尤其是通过耻骨下弯时，会引起尿道疼痛；

2、输尿管镜在进入膀胱、输尿管内部过程中，需要通过冲水将输尿管扩张开，在有腔道的情况下，输尿管镜进入不会损伤输尿管，所以在冲水过程中，水压到达肾盂，会引起肾脏的疼痛；

3、输尿管镜进入输尿管内部，导致输尿管痉挛，引起疼痛；

4、碎石过程中结石刺激会引起相关的疼痛。