灸神阙穴最大的好处是温补阳气，神阙穴位于肚脐当中，中医认为肚脐为内外交通的工具或通道，所以艾灸神阙穴可以将温补之气直接补进体内。一般神阙穴艾灸时会用隔盐灸，即将细盐或盐粒填于肚脐中，略高于皮肤，然后将艾状置于盐上点燃，可以使艾灸产生的温热之气，通过盐逐渐进入身体，避免过烫导致皮肤灼伤。

灸神阙穴除可以温补外，还可以调和脾胃、温经通络，对各种脾胃不和表现出来的食欲不振、腹胀、腹痛、便秘、腹泻，尤其是虚寒性的腹泻起到较好治疗。生殖系统问题如月经不调、痛经、崩漏、不孕不育等也可以选择艾灸神阙穴治疗。