动脉导管未闭治疗后的并发症根据不同的治疗方案来分析，比如介入治疗之后，因为需要吃3-6个月的阿司匹林抗凝的药物，所以术后可能会出现相应的比如消化系统的出血。另外，因为毕竟是放了封堵器进去，有可能会出现封堵器脱落，如果动脉导管比较粗大，放的封堵器型号偏大，早期会出现血小板消耗，可能会出现凝血功能异常，这是介入治疗的并发症。
如果是通过外科开胸，不管是结扎还是切断缝合也有并发症，切断不会出现再通，但是如果开胸结扎可能会出现结扎后再通的问题。另外，因为位置的问题可能会损伤到左侧喉返神经，后期可能会引起喉返神经功能失常，引起说话声音嘶哑、饮水呛咳。
