肺炎主要由病原微生物引起感染，常以细菌为主，占成人感染肺炎的80%以上，包括肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎支原体、肺炎衣原体、军团菌等。其中病毒性细菌中的肺炎链球菌，在临床上比较容易治疗。而病毒性的肺炎有传染性，病情较为凶险，但患病率较低，如导致高致病性人禽流感病毒性肺炎的H1N1、H5N1、H7N9等。