对于双肾同时发生结石的患者，主要取决于结石数量、结石大小。如果双肾多发都是很小的结石，对于这类患者，只需要进行多饮水、多排尿，对于很多患者，还可以配合一些排石中药，帮助患者把结石排出。
但如果双侧的结石都很大，特别是双侧的结石直径都在2cm以上，甚至发生了鹿角状结石，即结石按照肾盂肾盏的形状生长，充填整个肾盂肾盏，会同时对双侧肾功能造成影响，很多患者会出现急性肾功能不全。对于这类患者，通常要进行手术治疗。
对于双肾结石的患者，在手术治疗时，需要判断肾功能的好坏，如果肾功能非常正常，先治疗结石容易处理的这一侧结石。
如果已经出现肾功能不全，需要对病人进行检查，看哪一侧的肾功能比较好，先治疗肾功能比较好的这一侧肾结石，可以保证患者足够的肾功能来维持正常的生活。
