肠功能紊乱的病因很多，需要针对病因治疗。如腹痛患者应用缓解腹痛的药物，如解痉、调整胃肠道功能的药物；腹泻患者给予止泻剂及调整肠道菌群的药物；便秘患者给予缓泻剂或饮食调节肠道功能，如多吃香蕉、喝蜂蜜水等。肠道功能紊乱的临床表现表现多，治疗主要以对症状治疗为主。出现肠功能紊乱，不要自行用药，应在医生的指导下用药治疗。