非医学专业普通人通常会认为做胃镜会产生损害。事实上，胃镜是非常成熟的技术，已经有几十年历史，此项医疗技术用于人体做检查或治疗都是成熟的，它的危害性全部都是评估后可控的，甚至非常小。做胃镜基本对人体没有损害，但在某些情况下，会产生不适感或一些不可意料的后果。部分患者做胃镜后感觉嗓子有些微不适。检查结束后，出现这种情况很正常，因为管道毕竟需要从咽部通过。如果胃镜做的时间稍长，在咽部停留时间长，咽部会出现一定水肿，但时间非常短暂。做胃镜后吃颗口香糖或含颗润喉片即能解决，症状非常轻。但是做胃镜确实存在出现特殊情况的可能，在极少数情况下会发生，如某些部位的穿孔，或做胃镜取活检时，发生不能预测的术后出血，但几率非常低，经常是一整年也无一例术后出血、穿孔的情况。所以做胃镜是非常安全的。
