泮托拉唑是质子泵抑制剂，主要是抑制胃酸分泌。在发挥治疗作用的同时，还可能会带来副作用。但是副作用尤其是严重的副作用，在上市后的报道上比较罕见。
参考泮托拉唑的注射用药，比较严重的副作用主要是肝细胞损伤、肝细胞功能衰竭及黄疸。还可能会出现皮肤或皮下组织的问题，严重时也可能致死。
除此以外，尚未发现比较严重的毒副作用的报道。但只是参考其注射剂型，因为注射剂型的安全性比口服剂型差。所以注射用泮托拉唑的严重副作用，可能发生率高于口服剂型。
副作用的发生与口服剂量或用药剂量、使用时间相关，用量越大，使用时间越长，发生副作用的可能性就越大，症状可能越重。在使用泮托拉唑时，一定要按照医生指导用药。
如果涉及长期用药，要在定期复查、复诊的基础上，由医生决定或由检测结果，经过医生判断决定是否适合继续使用。
