低位直肠癌保肛手术的并发症，主要有以下几个：第一、最常见的并发症就是直肠前切除综合征，这种综合征是由于直肠切除以后，原来新建的直肠的顺应性减低，当结肠内的粪便排到直肠的时候，会因刺激引起黄色性的排便，所以会导致排便频繁，同时可以引起肛门坠胀感；第二、最严重的并发症就是吻合口瘘，吻合口长不好，粪便通过这个口漏到腹腔引起并发症；第三、手术以后的出血，包括腹腔出血、吻合口出血；第四、腹腔感染、切口感染；第五、性功能障碍，因为手术过程中，需要切除生殖系统的一些神经末梢，而且损伤到该神经末梢会导致手术以后性功能障碍，尤其是对于男性，可能会更为明显；第六、排尿功能障碍，因为同样的植物神经系统，在手术过程中多多少少会损伤到植物神经系统，会导致排尿功能障碍；第七、肿瘤的复发，对于一些中晚期的病人，术后复发也是并发症之一。除此之外，还有一些手术有并发症，包括肠梗阻、肠粘连等其他并发症。