服用抗结核药后如果出现腹泻，首先考虑药物刺激胃肠道痉挛，导致胃肠道蠕动加强。此时可以加用胃黏膜保护剂，如雷尼替丁、奥美拉唑。
在应用胃黏膜保护剂治疗以后，如果症状得到缓解，可以继续进行抗结核治疗、继续动态观察；如果患者症状加重，需除外合并消化道疾病，如消化道溃疡、消化道感染、肠道感染，此时患者需要到消化专科就诊，必要时需进行胃镜和肠镜检查。
在应用抗结核药时，部分患者会出现肝功能损害，亦可表现为消化道症状，出现恶心、呕吐、腹泻，此时需要完善肝肾功能相关检查。如果抽血查肝肾功能检查异常，考虑肝功能异常，需要进行护肝治疗；而如果肝功能正常，则需要除外其它疾病。
