肝内多发囊肿是临床中非常常见的一大类征象。通常影像学、B超、CT或者核磁均可发现。一种称为多发性肝囊肿，这种多发性肝囊肿是在临床中最为多见。通常是先天性，如果腹部无任何症状，未引起腹痛，未压迫周围脏器，也没有任何破裂的表现，通常无需过于紧张，定期观察即可。观察方法是用超声监测变化情况，如增长过快，或者位于边缘，体积过大，压迫邻近脏器，如胃、食管、十二指肠或者胆管，存在压迫症状时需要进行手术治疗，将囊肿开窗引流。如果患者年纪过大，无法耐受全麻手术，通过穿刺抽取囊液也可达到减压目的。

另外一种先天遗传疾病是多囊肝，临床中也较为常见。对于这种多囊肝没有较好的治疗方法，如果出现压迫症状，可进行外科囊肿开窗引流。但因为多囊肝患者的整个肝脏均会被囊泡所占据，最后出现肝功能受损，会进展到肝功能失代偿或者是肝功能衰竭的状态，这种情况下最终治疗方案是进行肝移植。