太阳穴附近疼痛的原因如下：

1、头颅内部器质性病变：需要行头颅核磁共振检查、头颅血管核磁共振检查，明确是否存在颅内占位性病变，如脑出血、脑梗死、脑肿瘤、血管瘤破裂、血管畸形等病变，建议及时到神经外科进行会诊、治疗；

2、颞下颌关节炎：牵扯颞肌导致太阳穴附近疼痛，同时出现耳部不适，建议行颞下颌关节平片检查，必要时进行核磁共振检查明确病因，没有器质性病变的情况下可以行颞下颌关节注射治疗；

3、颈部病变：颈椎退变、颈间盘突出、小关节病变导致的颈源性头痛会表现为太阳穴附近疼痛。