脊髓亚急性联合变性的病因是由于维生素B₁₂的摄入、吸收、结合、转化或代谢障碍，导致体内含量不足，而引起的中枢和周围神经系统变性的疾病。治疗包括药物治疗、康复训练和改善饮食结构。

一旦确诊为脊髓亚急性联合变性，就应该立即给予大剂量的维生素B₁₂治疗，否则会发生不可逆的神经损伤，总疗程6个月，维生素B₁₂吸收障碍的患者要终生服药。合用维生素B₁和维生素B₆，效果会更佳。

另外对于贫血的患者，要应用铁剂，如硫酸亚铁或者10%的枸橼酸铁，服用铁剂时，建议联合口服维生素C，可以促进铁剂吸收。如果对于恶性贫血的患者，建议叶酸与维生素B₁₂共同使用，不能单独地补充叶酸，否则会出现精神症状。

对于胃液中缺乏游离胃酸的萎缩性胃炎患者，可以服用胃蛋白酶合剂，或者饭前服用一些稀酸的合剂，减少因胃酸的缺乏引起的消化道症状。