上尿路结石的病人，当结石位于肾脏时常常没有明显症状；当结石较大刺激肾脏黏膜时，也会出现肾盏扩张，导致肾脏出现胀痛或钝痛症状，由于肾盏扩张积水，部分病人还会出现持续性腰胀、腰酸。当结石掉入输尿管时会引起剧烈的肾绞痛症状，病人常常表现为阵发性腰腹部绞痛，伴有恶心、呕吐，部分病人还会出现下腹部及会阴部放射性疼痛。
当结石梗阻引起肾积水时，还会导致持续腰痛症状，如合并感染时病人还会出现发热症状，严重时会引起脓肾，还会导致脓毒血症，病人会出现感染性中毒性休克症状。上尿路结石位于输尿管末端时，还会引起尿路刺激症状，病人会出现尿频、尿急、尿痛、排尿不尽。病人出现上述症状时常常和急腹症相鉴别，病人出现尿频、尿急、尿痛症状时，常伴有镜下血尿或肉眼血尿症状，而急腹症病人没有血尿症状。
