革兰氏阴性菌杆菌的感染治疗，一般要结合患者的情况进行综合分析，判断首选何种药物。通常因为不同部位的感染，社区或者院内获得感染的不同，以及病情的严重程度不同，所选择的抗菌药均有所区别。一般药物的选择有以下几种：

1、社区获得革兰氏阴性菌感染：如果患者本身没有严重的基础疾病，出现腹腔感染、肠道感染或者泌尿系统感染，通常会首选三代头孢或者氟喹诺酮类药物治疗。使用三代头孢时一般不会选择含有酶制剂的药物，使用普通的三代头孢药物即可；

2、社区获得性的严重革兰氏阴性菌感染：这种情况导致出现脓毒症休克，一般会首选碳青霉烯类的药物。由于患者病情比较严重，初期尚未明确感染病原，一般会选择比较强的抗菌药物，通常会应用抗感染治疗，在病情稳定之后逐渐降级，改为三代头孢或者哌拉西林、他唑巴坦、青霉素类药物；

3、医院获得的阴性菌感染：这种情况下需要注意可能存在耐药细菌的感染，通常会选择含有β-内酰胺酶抑制剂的三代头孢，比如头孢哌酮加舒巴坦，或者选择哌拉西林、他唑巴坦等药物；

4、医院获得的耐药阴性菌感染：患者由于长期住院，本身有严重的免疫功能低下或者居住在监护室，可能会感染耐药的细菌。这种情况下一般会根据耐药的细菌敏感性选择抗菌药物，可能会选择更为广谱的碳青霉烯类药物。有些会引起碳青霉烯耐药的阴性菌感染，可能会选择替加环素治疗。对于铜绿假单胞菌的感染，一般会选择碳青霉烯或者加酶抑制剂的头孢类抗生素、青霉素类抗生素等抗菌药物进行治疗。