手足口病主要是由于肠道病毒感染造成的儿童常见传染病，以五岁以下的孩子最多见。手足口病常见的病原体是肠道病毒，像柯萨奇病毒、ECHO病毒血清型、肠道病毒71型，以柯萨奇病毒16型和肠道病毒71型最常见。常见传染源主要是隐性感染者和患病人群，手足口病隐性感染者的比例非常高。

感染了病毒但症状太轻，或没有出现任何症状也没有出现任何体征，甚至生化学表现都没有，只有通过免疫学检查才发现，叫隐性感染者。隐性感染者虽然没发病，但携带病毒，是传染源的主力军，同样具有传染性。