手足口病传染源主要是患者以及隐性感染者，患者一般在起病后的1周内，属于传染性最强的阶段，可以通过消化道、呼吸道以及直接接触传播。应该避免与手足口病患者共同进餐，共用一套碗筷，近距离接触应该佩戴口罩，因为可以通过呼吸道飞沫传播。
手足口病患者的疱疹液当中也含有大量病毒，通过直接接触患者，包括接触患者所用的各种物品以及衣物，均有可能污染手，通过手摸口鼻或者直接拿取食物引起感染。手足口病的传染性非常强，而且传播途径非常广，很容易在儿童期间造成流行。
对于手足口病的患者，应该严格进行隔离治疗，护理者需要注意避免消化道、呼吸道以及直接接触感染。对于隐性感染者，因为感染手足口病后无临床发病，但患者粪便以及口腔唾液分泌物中，有可能含有病毒。但隐性感染者因为没有症状，所以容易引起忽视，非流行期间，隐性感染者有可能造成病例散发。
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