头颅CT和头颅核磁都是脑血管病的常用检查，但截然不同。具体区别如下：
1、头颅CT：应用X光原理，对于各个组织X光透视不一样，所以显示明暗不一，头颅CT有X光辐射，所以小孩、孕妇不能做，头颅CT为0.5cm或1cm扫一层，针对较小的病灶，或后循环如小脑脑干病变，头颅CT显示不清楚；
2、核磁共振：应用氢质子在组织中排列顺序的原理，辐射较小，小孩、孕妇可以进行头颅核磁或身体其他部位检查。头颅核磁检查比较细致，1mm一层扫描，可以显示清楚小病灶。
如果体内有钢板或铁钉等金属器物，需要禁止进行头颅核磁共振平扫，CT就不会影响。所以每个检查都有优点和缺点，医生会根据患者的病情，选择不同的检查项目，患者要根据医生的方案及时进行相关治疗。
