溃疡性结肠炎多发部位为左半结肠，约90%的患者累及直乙结肠，范围各有不同，大部分病变从直乙结肠向降结肠、横结肠及升结肠发展，与好发部位在右半结肠的克罗恩病、肠结核很好鉴别。但并不绝对，如全结肠型溃疡性结肠炎或累及右半结肠的溃疡性结肠炎，有可能在回盲部，即右半结肠出现病灶。

部分溃疡性结肠炎会出现倒灌性回肠炎，即在末端回肠出现病灶。一些远端结肠炎，即累及直乙结肠的溃疡性结肠炎会合并倒灌性回肠炎，会造成病灶跳跃，难以和克罗恩病鉴别，但是大部分溃疡性结肠炎的溃疡多发部位在左半结肠。