奥美拉唑不能与抗血小板药物中的阿司匹林、波立维联用，联用过程中，奥美拉唑容易影响阿司匹林、波立维的功效。阿司匹林和波立维主要是用于预防、治疗冠心病，若服用奥美拉唑后，容易影响近期包括一段时间内抗血小板药物的功效，从而引起冠心病再发或加重。若冠心病患者不能停用阿司匹林、波立维，此时只能改用其他质子泵抑制剂，如用泮托拉唑、雷贝拉唑代替奥美拉唑，泮托拉唑、雷贝拉唑的临床功效与奥美拉唑类似。
奥美拉唑与其他抗凝药物，如华法林，并不是绝对不能合用，不过在服药过程中可能导致凝血功能异常，影响部分需要服用华法林药物的患者的INR(国际标准化比值)。所以在使用过程中也需注意监测华法林的血药浓度、凝血指标，监测INR的变化。
