双侧肾脏囊肿吃什么药物最好，需要根据实际情况进行判断，具体如下：

1、良性囊肿：如果囊肿只是良性、单发性囊肿，在直径＜5cm时不需要特殊的治疗，也不需要服用药物，只需要在日常生活中动态观察，定期做泌尿系统彩超或者肾脏CT，观察囊肿增大的情况；

2、囊肿较大：如果直径达到5cm，需要在B超引导下做穿刺抽液处理，这时可以服用止血药物和消炎类药物，但是需根据情况服用；

3、肾脏老化：如果囊肿随着年龄增长逐步增大，有可能是肾脏老化的表现，所以不需要服用任何药物。肾脏老化而出现的肾脏囊肿，任何药物都无法阻4、恶性囊肿：如果双侧肾脏囊肿是恶性病变，需要进行手术处理，服用口服药物解决不了问题；

5、多囊肾：如果双肾囊肿是多囊肾造成，在双侧肾脏囊肿出现高血压或者肌酐升高时，需要服用降压药物以及排除毒素的药物进行治疗。降压药物首选钙离子拮抗剂，如果出现肌酐升高，要选用尿毒清、肾衰宁或者海昆肾喜等排毒药物，进行降低肌酐的治疗，如果出现贫血，需要服用铁剂或者促红细胞生成素、罗沙司他。