治疗慢性再生障碍性贫血首选免疫抑制剂，再生障碍性贫血是骨髓造血衰竭的疾病，导致外周血、全血细胞减少，即白细胞、血小板减少，同时合并贫血。慢性再生障碍贫血病情进展比较缓慢，临床以贫血为主要的表现，所以在治疗过程当中可能需要输血。慢性再障的治疗首选是免疫抑制治疗，一般选择环孢菌素，同时应用细胞刺激因子，比如促红细胞生成素、粒细胞集落刺激因子以及促血小板生成素共同应用，促进造血的恢复。同时可以应用雄激素、达那唑之类的药物，帮助血细胞的恢复。
慢性再生障碍性贫血的患者，也可以应用中药进行辅助治疗。慢性再生障碍贫血的病人，一般病程较长，治疗如果有效病情可以稳定。如果经上述治疗效果不好，慢性再生障碍性贫血的病患者可以进展为重型再生障碍性贫血，治疗就要按重型再障治疗。
