胆囊切除术的禁忌证主要是指不能耐受手术的人群，比如有严重的心脏疾病、严重的心肺疾病、不能耐受麻醉的情况，即不能手术，还有严重的凝血障碍，如血友病，包括血小板严重低下的病人，是胆囊切除术的禁忌证。
胆囊切除术在医学上最常见的是腹腔镜胆囊切除术，因为腹腔镜胆囊切除手术已经是胆囊手术的金标准，不能做胆囊切除术，即腹腔镜胆囊手术禁忌证，包括近期半年内做过心脏支架，然后有凝血功能障碍，比如凝血因子缺乏、血小板低于5万/mL，或者血小板不能低于3万/mL。
另外，严重的心肺功能不良，或者有疝气、腹外疝，因为做腹腔镜胆囊手术时，需要往腹腔里打气增加腹压，这样会加重腹疝。最后就是全身状况很差的病人、无法耐受手术的病人，这些都是腹腔镜胆囊切除术的禁忌证。
