囊肿根据其部位和大小不一样，症状也略有不同。对于比较小的囊肿，如体检时通过做超声发现的甲状腺小囊肿，可以是几个毫米，甚至1cm，或者肝脏内部的小囊肿，绝大多数没有症状。
而随着囊肿增大，会引起局部压迫症状，如肝脏比较大的囊肿，临床上可以见到有8cm或者10cm，同时局部张力较高。当囊肿张力比较高，可以造成局部疼痛不适的感觉。如妇科卵巢囊肿较大时，也会出现下腹部的胀疼。当囊肿扭转时，还会出现急腹症。当囊肿破裂时会导致出血，甚至急性腹疼。
因此，囊肿的症状根据其大小、位置，以及是否发生破裂和扭转都有关系。建议患者一旦出现囊肿，在比较小时不急于进行任何干预，可以临床观察。而一旦比较大，随时有破裂风险，就应该积极采用手术方法进行切除。
