心内膜炎最常见的病因是感染，因此心内膜炎症状主要与感染和心肌及瓣膜受损相关。发热是心内膜炎最常见的症状，主要是感染引起机体反应。
除少数老年患者或者重度衰竭虚弱的患者，几乎所有的心内膜炎起病后均存在着午后和夜间发热，体温大多波动在37.5-39℃，也可高达40℃。
同时还常伴有头痛、背痛和肌肉关节疼痛，主要累及腓肠肌和骨部肌肉。超过85%的心内膜炎患者在听诊时，发现有新发心脏杂音。如果既往存在瓣膜疾病，则表现为原有杂音发生性质改变。
由于心内膜炎常引发微血管炎或微血管栓塞，因此可以出现外周血管受累的一系列表现，如视网膜卵圆形出血斑、皮肤及口腔黏膜和眼睑部位多发瘀点、手指或脚趾出现豌豆大小的结节等。
如果心内膜炎产生的瓣膜赘生物发生脱落，则会引起多发性栓塞，如肢体动脉栓塞和肺栓塞等。
