双歧杆菌一般吃4-6周，实际上也要根据病因进行具体分析。如果是急性肠炎短暂扰动了肠腔环境，出现拉肚子等情况，一般吃2周左右。如果是慢性肠炎或者反复多次发作急性肠炎，在不明原因的吃凉的或者着凉的情况下发作肠炎，则可能吃的时间要长一点。如果病史有半年以上，可能需要服药4-6周，甚至6-8周。
常规在双歧杆菌的说明书上推荐是2周，主要是针对一次性的急性的胃肠炎。根本来说，双歧杆菌起效需要1周左右的时间，将不正常的菌压下去，使正常菌有机会长起来。但这时并不代表可以停药，一定得吃够量，让正常菌的比例长到一定的稳定的情况，足以靠自己的数量压制条件致病菌的时候才可以停止用药。当然，也要结合双歧杆菌的副作用和辅料等因素进行具体分析。
总体来说，双歧杆菌的安全性较高，副作用并不多，几乎不入血，因此服用起来的安全性、服用时间都是可调的。
