心脏有小孔通常是指卵圆孔未闭、房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭等先天性的结构性心脏病，主要危害是心脏内左右交通，具体如下：

1、如果是心脏左边的动脉血进入静脉右心系统，会增加心脏负担，导致心力衰竭；

2、少部分人群会出现右向左的分流，即右边静脉血或者深静脉血栓进入动脉系统，会堵塞组织、器官的供血，比如导致中风，即部分青壮年不明原因的脑梗，也称心源性中风。

卵圆孔未闭患者主要会出现反复发作的头疼和心源性脑卒中，而房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭这类异常通道主要是从左心到右心的异常的分流，加重右心的负担，最后出现肺动脉高压、右心扩大、心力衰竭。卵圆孔未闭发生率比较高，但并非每个人均会出现头疼、中风，所以所占比例比较小，主要取决于卵孔未闭形态，心脏是否存在房间隔膨胀瘤，以及先天性下腔静脉瓣等情况，共存危险因素的多少决定其具体症状。