新生儿反复肺炎的原因主要是免疫系统、免疫器官发育不成熟，抵抗力相对成人和儿童较低下。影响新生儿免疫状态的主要有以下几个因素：

1、分娩方式：阴道分娩的新生儿免疫力一般好发于剖腹产的新生儿；

2、喂养方式：母乳喂养的新生儿免疫力较人工喂养的新生儿免疫力强；

3、是否足月：早产儿免疫系统发育更加不成熟，更容易发生感染；

4、肠道微生物：肠道微生物菌群的建立有助于儿童免疫系统的建立，可以给予儿童适当口服益生菌，帮助建立肠道微生物菌群。