肩胛骨疼痛时进行CT检查，不一定能够确诊具体疾病。因为肩胛骨疼痛病因较多，除骨质病变外，孩可能为软组织病变，如斜方肌、背阔肌、肩胛提肌等，肌肉劳损、筋膜无菌性炎症，或附着韧带的损伤及其他软组织病变，均可引起肩胛骨区域疼痛。部分内脏系统病变，如心脏病、胸腔病变、胸膜炎，也会引起肩胛骨部位的放射状疼痛。
CT是通过X光成像的检查方法，其特征是通过组织密度，即通过对X光吸收能力不同，而显示不同密度，从而做出病情判断，对于骨性疾病，如骨折、骨质破坏等这类骨性的改变比较清楚。但对于软组织病变并没有优势，即软组织在CT内的分辨率较低。因此对于软组织病变，尽量还要采取其他相应检查方式，如磁共振，必要时磁共振增强，还有局部彩超检查，此外如果怀疑肿瘤性病变，可能还需结合病理学检查，进行穿刺活检以明确诊断。
